Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtmQ62388 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AtmQ62388 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AtmQ62388 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AtmQ62388 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtmQ62388 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtmQ62388 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtmQ62388 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AtmQ62388 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtmQ62388 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtmQ62388 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AtmQ62388 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtmQ62388 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AtmQ62388 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtmQ62388 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms