Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TfrcQ62351 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TfrcQ62351 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TfrcQ62351 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TfrcQ62351 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TfrcQ62351 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms