Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VcanQ62059 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcanQ62059 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VcanQ62059 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VcanQ62059 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcanQ62059 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcanQ62059 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcanQ62059 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcanQ62059 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VcanQ62059 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcanQ62059 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcanQ62059 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VcanQ62059 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VcanQ62059 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcanQ62059 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcanQ62059 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms