Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itm2aQ61500 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2aQ61500 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Itm2aQ61500 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms