Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hif1aQ61221 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hif1aQ61221 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hif1aQ61221 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hif1aQ61221 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms