Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc6Q61143 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpc6Q61143 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc6Q61143 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc6Q61143 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc6Q61143 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpc6Q61143 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms