Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HarsQ61035 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HarsQ61035 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HarsQ61035 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms