Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Neurod1Q60867 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Neurod1Q60867 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Neurod1Q60867 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Neurod1Q60867 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Neurod1Q60867 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Neurod1Q60867 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Neurod1Q60867 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Neurod1Q60867 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Neurod1Q60867 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Neurod1Q60867 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Neurod1Q60867 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Neurod1Q60867 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Neurod1Q60867 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms