Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfaip3Q60769 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip3Q60769 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip3Q60769 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfaip3Q60769 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfaip3Q60769 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip3Q60769 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms