Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P4ha1Q60715 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P4ha1Q60715 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P4ha1Q60715 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
P4ha1Q60715 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4ha1Q60715 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P4ha1Q60715 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P4ha1Q60715 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms