Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Lmtk3Q5XJV6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lmtk3Q5XJV6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lmtk3Q5XJV6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lmtk3Q5XJV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lmtk3Q5XJV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmtk3Q5XJV6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lmtk3Q5XJV6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmtk3Q5XJV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmtk3Q5XJV6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmtk3Q5XJV6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmtk3Q5XJV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lmtk3Q5XJV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lmtk3Q5XJV6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms