Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim38Q5SZ99 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim38Q5SZ99 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim38Q5SZ99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim38Q5SZ99 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim38Q5SZ99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms