Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Specc1Q5SXY1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Specc1Q5SXY1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Specc1Q5SXY1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Specc1Q5SXY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Specc1Q5SXY1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Specc1Q5SXY1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms