Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc42Q5SV66 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc42Q5SV66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc42Q5SV66 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc42Q5SV66 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms