Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sun3Q5SS91 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sun3Q5SS91 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sun3Q5SS91 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sun3Q5SS91 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sun3Q5SS91 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sun3Q5SS91 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms