Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trim58Q5NCC9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trim58Q5NCC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim58Q5NCC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim58Q5NCC9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trim58Q5NCC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim58Q5NCC9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim58Q5NCC9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms