Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH7

Spdya, Speedy protein A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdyaQ5IBH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SpdyaQ5IBH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SpdyaQ5IBH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SpdyaQ5IBH7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SpdyaQ5IBH7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SpdyaQ5IBH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SpdyaQ5IBH7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpdyaQ5IBH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SpdyaQ5IBH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms