Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afap1l2Q5DTU0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Afap1l2Q5DTU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afap1l2Q5DTU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afap1l2Q5DTU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Afap1l2Q5DTU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afap1l2Q5DTU0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afap1l2Q5DTU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afap1l2Q5DTU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afap1l2Q5DTU0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afap1l2Q5DTU0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afap1l2Q5DTU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms