Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdp2Q504M2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdp2Q504M2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdp2Q504M2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdp2Q504M2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdp2Q504M2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms