Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc84Q4VA36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc84Q4VA36 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc84Q4VA36 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc84Q4VA36 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc84Q4VA36 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc84Q4VA36 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms