Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6430531B16RikQ3V2J1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6430531B16RikQ3V2J1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
6430531B16RikQ3V2J1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms