Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mtmr11Q3V1L6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr11Q3V1L6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr11Q3V1L6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mtmr11Q3V1L6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms