Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ampd1Q3V1D3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ampd1Q3V1D3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ampd1Q3V1D3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ampd1Q3V1D3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ampd1Q3V1D3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ampd1Q3V1D3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ampd1Q3V1D3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ampd1Q3V1D3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ampd1Q3V1D3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ampd1Q3V1D3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd1Q3V1D3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms