Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Garnl3Q3V0G7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Garnl3Q3V0G7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Garnl3Q3V0G7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms