Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrfip1Q3UZ39 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrfip1Q3UZ39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrfip1Q3UZ39 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrfip1Q3UZ39 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms