Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnpc3Q3UZ01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rnpc3Q3UZ01 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rnpc3Q3UZ01 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnpc3Q3UZ01 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnpc3Q3UZ01 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms