Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF9

Faxc, Failed axon connections homolog, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FaxcQ3UMF9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FaxcQ3UMF9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FaxcQ3UMF9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FaxcQ3UMF9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FaxcQ3UMF9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FaxcQ3UMF9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FaxcQ3UMF9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms