Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cobll1Q3UMF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cobll1Q3UMF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cobll1Q3UMF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cobll1Q3UMF0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cobll1Q3UMF0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms