Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc34Q3UI66 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc34Q3UI66 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc34Q3UI66 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc34Q3UI66 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc34Q3UI66 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms