Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccser2Q3UHI0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccser2Q3UHI0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccser2Q3UHI0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccser2Q3UHI0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccser2Q3UHI0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser2Q3UHI0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms