Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Zswim8Q3UHH1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zswim8Q3UHH1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zswim8Q3UHH1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zswim8Q3UHH1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zswim8Q3UHH1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Zswim8Q3UHH1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Zswim8Q3UHH1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zswim8Q3UHH1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zswim8Q3UHH1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zswim8Q3UHH1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Zswim8Q3UHH1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zswim8Q3UHH1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zswim8Q3UHH1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms