Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn7l3bQ3UD01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn7l3bQ3UD01 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn7l3bQ3UD01 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn7l3bQ3UD01 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn7l3bQ3UD01 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms