Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3U6N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3U6N9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3U6N9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3U6N9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3U6N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3U6N9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3U6N9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3U6N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3U6N9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3U6N9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3U6N9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3U6N9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3U6N9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3U6N9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3U6N9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms