Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
D17Wsu92eQ3TT38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
D17Wsu92eQ3TT38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
D17Wsu92eQ3TT38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms