Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp39Q3TIX9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp39Q3TIX9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp39Q3TIX9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp39Q3TIX9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp39Q3TIX9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms