Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc127Q3TC33 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc127Q3TC33 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc127Q3TC33 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc127Q3TC33 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms