Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pi4k2aQ2TBE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pi4k2aQ2TBE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pi4k2aQ2TBE6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Pi4k2aQ2TBE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pi4k2aQ2TBE6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pi4k2aQ2TBE6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms