Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna5Q2MKA5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Chrna5Q2MKA5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Chrna5Q2MKA5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chrna5Q2MKA5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chrna5Q2MKA5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Chrna5Q2MKA5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chrna5Q2MKA5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms