Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phactr1Q2M3X8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phactr1Q2M3X8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phactr1Q2M3X8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr1Q2M3X8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr1Q2M3X8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr1Q2M3X8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms