Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Specc1lQ2KN98 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Specc1lQ2KN98 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Specc1lQ2KN98 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Specc1lQ2KN98 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Specc1lQ2KN98 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1lQ2KN98 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms