Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gata4Q08369 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gata4Q08369 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gata4Q08369 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms