Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MestQ07646 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MestQ07646 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MestQ07646 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MestQ07646 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MestQ07646 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MestQ07646 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MestQ07646 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MestQ07646 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MestQ07646 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MestQ07646 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MestQ07646 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MestQ07646 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MestQ07646 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MestQ07646 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MestQ07646 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MestQ07646 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MestQ07646 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MestQ07646 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MestQ07646 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MestQ07646 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MestQ07646 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MestQ07646 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MestQ07646 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MestQ07646 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MestQ07646 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MestQ07646 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MestQ07646 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MestQ07646 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MestQ07646 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MestQ07646 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MestQ07646 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MestQ07646 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MestQ07646 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MestQ07646 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MestQ07646 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MestQ07646 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MestQ07646 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MestQ07646 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MestQ07646 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MestQ07646 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MestQ07646 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MestQ07646 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MestQ07646 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MestQ07646 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MestQ07646 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MestQ07646 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MestQ07646 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MestQ07646 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MestQ07646 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MestQ07646 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MestQ07646 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MestQ07646 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MestQ07646 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MestQ07646 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MestQ07646 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MestQ07646 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MestQ07646 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MestQ07646 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MestQ07646 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MestQ07646 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MestQ07646 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MestQ07646 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MestQ07646 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MestQ07646 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MestQ07646 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MestQ07646 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MestQ07646 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MestQ07646 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MestQ07646 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MestQ07646 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MestQ07646 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MestQ07646 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MestQ07646 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MestQ07646 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MestQ07646 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MestQ07646 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MestQ07646 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MestQ07646 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MestQ07646 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MestQ07646 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MestQ07646 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MestQ07646 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MestQ07646 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MestQ07646 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MestQ07646 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MestQ07646 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MestQ07646 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MestQ07646 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MestQ07646 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MestQ07646 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms