Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmbpQ07456 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmbpQ07456 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmbpQ07456 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.8 ms