Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdx4Q07424 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdx4Q07424 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdx4Q07424 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms