Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gdf9Q07105 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf9Q07105 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf9Q07105 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdf9Q07105 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf9Q07105 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.3 ms