Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk18Q04899 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk18Q04899 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk18Q04899 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk18Q04899 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk18Q04899 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk18Q04899 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1392.3 ms