Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl7Q03366 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl7Q03366 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccl7Q03366 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccl7Q03366 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl7Q03366 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms