Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Runx1Q03347 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Runx1Q03347 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Runx1Q03347 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Runx1Q03347 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Runx1Q03347 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.1 ms