Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb4Q02738 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb4Q02738 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gjb4Q02738 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb4Q02738 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb4Q02738 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb4Q02738 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms