Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Top2aQ01320 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Top2aQ01320 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Top2aQ01320 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Top2aQ01320 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Top2aQ01320 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Top2aQ01320 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Top2aQ01320 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2aQ01320 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms